2006出場校一覧
岡山 関西(2年連続7度目)
10-0岡山操山
4-3岡山理大付
5-0金光学園
9-3岡山学芸館
2-1岡山城東
広島 如水館(5年ぶり5度目)
10-0油木
7-1庄原実
7-6広島工
11-4神辺旭
10-1城北
11-7広島商
2-0崇徳
鳥取 倉吉北(4年ぶり6度目)
6-2米子東
7-3米子工
6-1鳥取城北
10-4倉吉東
島根 開星(4年ぶり4度目)
11-4出雲
5-1三刀屋
11-3立正大淞南
7-1浜田
9-5出雲北陵
山口 南陽工(28年ぶり2度目)
6-2桜ヶ丘
4-1光
4-0宇部高専
5-3下関商
15-3多々良学園
香川 香川西(3年ぶり2度目)
2-0坂出
11-4津田
4-1三本松
6-3高松桜井
5-2寒川
徳島 徳島商(6年ぶり21度目)
9-1鳴門工
2-0生光学園
7-2新野
6-5海部
9-3徳島北
愛媛 今治西(3年ぶり9度目)
10-4松山北
9-2大洲
10-2松山商
6-3帝京五
7-2済美
11-2今治北
高知 高知商(9年ぶり22度目)
10-0窪川
13-8清水
4-2伊野商
7-0小津
11-6明徳義塾
福岡 福岡工大城東(9年ぶり2度目)
10-0伝習館
11-0南筑
7-0須恵
4-0九産大九州
2-1久留米商
2-1筑陽学園
14-1柳川
佐賀 佐賀商(2年連続14度目)
11-0杵島商
11-6唐津東
8-0鹿島
6-4鳥栖
10-4佐賀西
長崎 清峰(2年連続2度目)
8-0対馬
6-1長崎北
6-1佐世保北
15-5長崎南山
2-0波佐見
熊本 熊本工(3年連続18度目)
7-0多良木
9-0宇土
10-2鎮西
8-1文徳
14-0城北
15-5専大玉名
大分 鶴崎工(17年ぶり3度目)
5-2中津商
11-10津久見
6-1大分雄城台
4-2楊志館
7-6明豊
宮崎 延岡学園(6年ぶり5度目)
8-2鵬翔
7-1宮崎西
6-4宮崎一
2-1日章学園
9-1宮崎日大
鹿児島 鹿児島工(初出場)
14-0南大隅
11-1岩川
10-1大口
5-4宮之城
5-4川内
8-7鹿屋
沖縄 八重山商工(初出場)
8-2北谷
4-3糸満
9-2豊見城
4-0前原
1-0浦添商
7-3中部商